CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Biologie Structurale

Techniques biophysiques

Responsable Maria MATE

Le service « techniques biophysiques » offre un ensemble d’équipements de pointe pour la caractérisation de complexes moléculaires et le criblage ou l’analyse d’interactions moléculaires, en solution ou sur support solide. Ces outils sont particulièrement adaptés à l’étude des complexes de type :

  • protéine/protéine
  • protéine/acide nucléique
  • protéine/petite molécule
  • protéine/détergent

Accessibilité

Académiques et industriels

Comment faire une demande ?

Compléter le formulaire à partir de
http://frisbi.eu/submit-a-proposal/
en cliquant “Marseille” à partir de l’item “Biophysical facility”
Contact AFMB : Maria Mate

Equipement spécifique

  • Titration Calorimétrique Isotherme (ITC) : MicroCal iTC200 (Malvern Panalytical)
  • Thermophorèse à micro échelle (MST) : Monolith NT.115 (NanoTemper Technologies GmbH)
  • Gel filtration analytique/diffusion statique de la lumière multi angle/ réfractométrie (SEC-MALS) :
    HPLC Ultimate 3000 (Thermo Scientific)/ Dawn 8 (Wyatt)/ Optilab (Wyatt)
  • Interférométrie (BLI) : Octet RED96 et Blitz (ForteBio, Molecular Devices)
  • Gel filtration analytique/Detection par fluorescence (FSEC) : HPLC Dionex/détecteur de fluorescence (Thermo Scientific)
  • Nano differential scanning fluorimetry (nanoDSF) : Tycho (NanoTemper Technologies GmbH)
  • Diffusion dynamique de la lumière (DLS) : Zetasizer (Malvern Panalytical)
  • Dichroïsme circulaire (CD) : J-810 (Jasco)

Coût

A définir en fonction du projet.

Publications

  • Fuchsbauer O, et al. (2019) Cas9 Allosteric Inhibition by the Anti-CRISPR Protein AcrIIA6. Mol Cell. 2765(19):30697-5.
  • Bauer L, et al. (2019) Fluoxetine Inhibits Enterovirus Replication by Targeting the Viral 2C Protein in a Stereospecific Manner. ACS Infect Dis. 5 (9):1609-1623
  • Tsika AC, et al. (2019) Deciphering the Nucleotide and RNA Binding Selectivity of the Mayaro Virus Macro Domain. J Mol Biol. 431(12):2283-2297
  • Nguyen PC, et al. (2018) Biochemical and Structural Characterization of TesA, a Major Thioesterase Required for Outer-Envelope Lipid Biosynthesis in M. tuberculosis. J Mol Biol 430 : 5120-5136
  • Nguyen VS, et al. (2018) Towards a complete structural deciphering of Type VI secretion system. Curr Opin Struct Biol 49 77-84
  • Leone P, et al. (2018) Type IX secretion system PorM and gliding machinery GldM form arches spanning the periplasmic space. Nat Commun 9 429
  • Nguyen VS, et al. (2017) Type VI secretion TssK baseplate protein exhibits structural similarity with phage receptor-binding proteins and evolved to bind the membrane complex. Nat Microbiol 2 17103
  • Ravachol J, et al. (2016) Mechanisms involved in xyloglucan catabolism by the cellulosome-
  • Foos N, et al. (2015) A flexible extension of the Drosophila ultrabithorax homeodomain defines a novel Hox/PBC interaction mode. Structure 23(2):270-9
  • De la Cruz MA, et al. (2013) A toxin-antitoxin module of Salmonella promotes virulence in mice. PLoS Pathog. 12:e1003827
  • Mate MJ, et al. (2012) Crystal structure of the DNA-bound VapBC2 antitoxin/toxin pair from Rickettsia felis. Nucleic Acids Res 40 3245-58
  • Douzi B, et al. (2011) Deciphering the Xcp Pseudomonas aeruginosa type II secretion machinery through multiple interactions with substrates. J Biol Chem. 40792-801
  • Felisberto-Rodrigues C, et al. (2011) Towards a structural comprehension of bacterial type VI secretion systems : characterization of the TssJ-TssM complex of an Escherichia coli pathovar. PLoS Pathog. 7 e1002386
  • Habchi J, et al. (2011) Characterization of the interactions between the nucleoprotein and the phosphoprotein of Henipavirus. J Biol Chem. 13583-602
  • Sciara G et al (2010) Structure of lactococcal phage p2 baseplate and its mechanism of activation. Proc Natl Acad Sci USA. 107 6852-7
  • Veesler D, et al. (2009) Production and biophysical characterization of the CorA transporter from Methanosarcina mazei. Anal Biochem. 388 115-21.
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