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Plateforme de Criblage Marseille-Luminy

Responsable Jean-Claude GUILLEMOT

La plateforme de criblage Marseille – Luminy (PCML) est impliquée dans de nombreux domaines de la recherche antivirale et du drug design. Nos offres sont pensées pour être aussi modulables que possible, permettant aux chercheurs de choisir plusieurs options (collaboration, prestations de service …). PCML propose son expérience et son savoir-faire à plusieurs niveaux :

  • Le criblage d’inhibiteurs des protéines et enzymes virales
    • Criblage sur des enzymes virales et caractérisation biochimique
    • Criblage d’inhibiteurs d’interactions protéine-protéine ou protéine-ligand
    • Détermination de cytotoxicité et criblage cellulaire de composés
    • Miniaturisation d’essais biochimiques en criblage à haut-débit
  • La fourniture de chimiothèques
    • Issues des chimiothèques de l’AFMB
    • Issues de chimiothèques orientées
    • Synthèse de chimiothèques orientées et études SAR
  • Le développement de nouvelles technologies
    • Miniaturisation d’essais
    • BRET in situ
    • Essais en fluorescence
    • Développement de tests (par ex, HTRF)

Il est également possible de cribler l’activité inhibitrice de nos composés sur une enzyme d’intérêt, ou encore de cribler des composés extérieurs sur nos enzymes.

PCML est intégrée au sein de la plateforme AD2P (Antiviral Drug Design Platform). Ce réseau collaboratif est en place depuis 2005 et se compose de PCML, de la plateforme de criblage viral Marseille-Timone (PCVMT, resp. Gilles Querat) et de la plateforme Interactions, Dynamique et Drug design (INT-3D, resp. Xavier Morelli). La combinaison de nos expériences respectives créée ainsi une interface dynamique propice au développement et à l’optimisation des projets.

Accessibilité

Académiques et industriels

Contact

Chimiothèques à fournir, essais à développer, services :
Pr. Jean-Claude Guillemot

Equipement spécifique

  • 1 chimiothèque de près de 60 000 composés
  • 1 laboratoire de type 2 d’expérimentations en radioactivité
  • 1 laboratoire de type 2 d’expérimentations en culture cellulaire
  • 1 robot Beckman NX équipé d’une tête 96 puits
  • 1 robot Beckman 3000 avec têtes 1 et 8 puits
  • 1 compteur à scintillation WallacMicroBeta trilux (Perkin Elmer)
  • 1 phospho-imager Fujifilm (Life science)
  • 1 PheraStar omega (BMG Labtech)
  • 1 fluorimètre Tecan Safire2
  • 1 base de données LISM

Coût

A définir en fonction du projet.

Publications liées à notre ressource ou développements méthodologiques

  • Alkylated flavanones from the bark of Cryptocarya chartacea as dengue virus NS5 polymerase inhibitors (2011) Allard PM, Dau ET, Eydoux C, Guillemot JC, Dumontet V, Poullain C, Canard B, Gueritte F, Litaudon M. J Nat Prod 74:2446-53
  • Dengue virus replicons : production of an interserotypic chimera and cell lines from different species, and establishment of a cell-based fluorescent assay to screen inhibitors, validated by the evaluation of ribavirin’s activity (2010) Masse N, Davidson A, Ferron F, Alvarez K, Jacobs M, Romette JL, Canard B, Guillemot JC. Antiviral Res 86:296-305
  • Biochemical characterization of the (nucleoside-2\’O)-methyltransferase activity of dengue virus protein NS5 using purified capped RNA oligonucleotides 7MeGpppACn and GpppACn (2010) Selisko B, Peyrane FF, Canard B, Alvarez K, Decroly E. J Gen Virol 91:112-21
  • Identification of allosteric inhibitors blocking the Hepatitis C Virus polymerase NS5B in the RNA synthesis initiation step (2009) Betzi S, Eydoux C, Bussetta C, Blemont M, Leyssen P, Debarnot C, Ben-Rahou M, Haiech J, Hibert M, Gueritte F, Grierson DS, Romette JL, Guillemot JC, Neyts J, Alvarez K, Morelli X, Dutartre H, Canard B. Antiviral Res 84:48-59

Pour plus d’informations...

Prestations de services :

  • Institut REGA Louvain/Belgique (projet SILVER) : Fourniture d’une chimiothèque (ChemBridge)
  • AFMB équipe « Désordre structural et reconnaissance moléculaire » : Développement et miniaturisation d’un test HTRF
  • Institut REGA Louvain/Belgique : Détermination des IC50 d’inhibiteurs potentiels sur la polymérase du virus de la Dengue (Flaviviridae)
  • Société X : Criblage de molécules d’intérêt et détermination d’IC50 sur la polymérase du virus de l’hépatite C.
  • Société X : développement d’un essai spécifique sur la protéine NS5 du virus de la Dengue et criblage de composés.
  • Société Fabre : criblage de composés sur la méthyl transférase de différents virus.

Collaborations :

  • Etude multicentrique, F. Ausseil (CNRS-Fabre), L. Lafanechère (UJF-Grenoble), P. Villa (Strasbourg).
  • Ecole de pharmacie de Bombay, Mumbai : Criblage de molécules potentiellement inhibitrices issues de l’école de pharmacie de Bombay sur quatre méthyltransférase « maison » ((Coronaviridae, Flaviviridae, human)
  • FP7 projet européen SILVER (Small-molecule Inhibitor Leads Versus emerging and neglected RNA viruses) : Caractérisation de plusieurs molécules inhibitrices sur les polymérases de Picornaviridae (spécificité, valeurs de Ki, type d’inhibition) et caractérisation de molécules inhibitrices sur la polymérase du virus de la Dengue
  • Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), la faculté de Pharmacie UMR 8076 Université Paris-Sud et le LIVE-UNCEA université de Nouvelle Calédonie : Criblage d’extraits naturels et de fractions (fractionnement bioguidé), découverte d’inhibiteurs de la polymérase du virus de la Dengue, caractérisation biochimique et spécificité, détermination de la cytotoxicité et du potentiel inhibiteurs des molécules sur système replicon.
  • Institut Curie (Paris), l’institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN) et l’école de Biotechnologie et de Pharmacie Strasbourg dans le cadre de l’ARN Dengue : Criblage de la chimiothèque nationale, découverte d’inhibiteurs de la polymérase du virus de la Dengue, caractérisation biochimique d’inhibiteurs et spécificité, détermination de la cytotoxicité et du potentiel inhibiteurs des molécules sur système replicon
  • FP6 projet européen VIZIER (Comparative Structural genomics of Viral Enzymes involved in Replication) : Découverte d’un inhibiteur de nucléoside-2’O méthyl transférase du virus de la Dengue, criblage de molécules sur la polymérase B3 du virus Coxsackie (Picornaviridae)
  • Collaboration avec le centre de recherche des maladies infectieuses, école de chimie et biosciences moléculaires, Université de Queensland : Test de l’effet inhibiteur sur l’activité polymérase d’anticorps anti-NS5 du virus West-Nile
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