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Projets de l’Equipe Longhi

Développement de MeDor, un metaserveur pour la prédiction du désordre chez les protéines

Responsables Sonia LONGHI

En collaboration avec le groupe de Bruno Canard au sein de l’AFMB, nous avons développé MeDor, un metaserveur pour la prédiction du désordre chez les protéines [1]. Ce serveur accélère considérablement le processus d’analyse des séquences protéiques puisqu’il permet l’analyse simultanée d’une séquence par plusieurs prédicteurs de désordre. Ce programme fournit un output graphique (voir Figure 8 pour un exemple) qui peut être annoté, sauvé, imprimé et utilisé à des fins de publication. Le programme est librement téléchargeable depuis http://www.vazymolo.org/MeDor/index.html. De plus, nous travaillons actuellement sur l’évaluation expérimentale et validation de différents consensus. Ces derniers sont générés par MeDor et sont basés sur des méthodes de calcul/pondération différentes.

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Figure 8
Exemple d’output de MeDor

Notes


[1] Lieutaud P, Canard B, Longhi S (2008) BMC Genomics 9 Suppl 2 S25
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