CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsables Bernard HENRISSAT, Nicolas TERRAPON

Dernières Publications

  1. Characterization of the CAZy Repertoire from the Marine-Derived Fungus Stemphylium lucomagnoense in Relation to Saline Conditions (2020) Ben Ali W, Navarro D, Kumar A, Drula E, Turbe-Doan A, Correia LO, Baumberger S, Bertrand E, Faulds CB, Henrissat B, Sciara G, Mechichi T, Record E. Mar Drugs 18(9) E461 PMID:32916905
  2. Proteome specialization of anaerobic fungi during ruminal degradation of recalcitrant plant fiber (2020) Hagen LH, Brooke CG, Shaw CA, Norbeck AD, Piao H, Arntzen MO, Olson HM, Copeland A, Isern N, Shukla A, Roux S, Lombard V, Henrissat B, O'Malley MA, Grigoriev IV, Tringe SG, Mackie RI, Pasa-Tolic L, Pope PB, Hess M. ISME J. in press PMID:32929206
  3. Characterization of the b-glucuronidase Pn3Pase as the founding member of glycoside hydrolase family GH169 (2020) Wantuch PL, Jella S, Duke JA, Mousa JJ, Henrissat B, Glushka J, Avci FY. Glycobiology in press PMID:32810871
  4. Analysis of the diversity of the glycoside hydrolase family 130 in mammal gut microbiomes reveals a novel mannoside-phosphorylase function (2020) Li A, Laville E, Tarquis L, Lombard V, Ropartz D, Terrapon N, Henrissat B, Guieysse D, Esque J, Durand J, Morgavi DP, Potocki-Veronese G. Microb Genom in press PMID:32667876
  5. Revisiting old questions and new approaches to investigate the fungal cell wall construction (2020) Blatzer M, Beauvais A, Henrissat B, Latge JP. Curr Top Microbiol Immunol 425 331-369 PMID:32418033
  6. A catalog of microbial genes from the bovine rumen unveils a specialized and diverse biomass-degrading environment (2020) Li J, Zhong H, Ramayo-Caldas Y, Terrapon N, Lombard V, Potocki-Veronese G, Estelle J, Popova M, Yang Z, Zhang H, Li F, Tang S, Yang F, Chen W, Chen B, Li J, Guo J, Martin C, Maguin E, Xu X, Yang H, Wang J, Madsen L, Kristiansen K, Henrissat B, Ehrlich SD, Morgavi DP. Gigascience 9 giaa057 PMID:32473013
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Pedro M COUTINHO
Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
UNK
Bastian HORNUNG
Aurore LABOUREL
Vincent LOMBARD
Nicolas TERRAPON

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