CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Nicolas TERRAPON

Dernières Publications

  1. A-Galactosidase and Sucrose-Kinase Relationships in a Bi-functional AgaSK Enzyme Produced by the Human Gut Symbiont Ruminococcus gnavus E1 (2020) Lafond M, Tauzin AS, Bruel L, Laville E, Lombard V, Esque J, Andre I, Vidal N, Pompeo F, Quinson N, Perrier J, Fons M, Potocki-Veronese G, Giardina T. Front Microbiol. 11 579521 PMID:33281771
  2. Galactosaminogalactan activates the inflammasome to provide host protection (2020) Briard B, Fontaine T, Samir P, Place DE, Muszkieta L, Malireddi RKS, Karki R, Christgen S, Bomme P, Vogel P, Beau R, Mellado E, Ibrahim-Granet O, Henrissat B, Kalathur RC, Robinson C, Latge JP, Kanneganti TD. Nature 588 688-692 PMID:33268895
  3. Identification of the molecular determinants driving the substrate specificity of fungal lytic polysaccharide monooxygenases (LPMOs) (2020) Frandsen KEH, Haon M, Grisel S, Henrissat B, Lo Leggio L, Berrin JG. J Biol Chem in press PMID:33199373
  4. Genomic analysis enlightens Agaricales lifestyle evolution and increasing peroxidase diversity (2020) Ruiz-Duenas FJ, Barrasa JM, Sanchez-Garcia M, Camarero S, Miyauchi S, Serrano A, Linde D, Babiker R, Drula E, Ayuso-Fernandez I, Pacheco R, Padilla G, Ferreira P, Barriuso J, Kellner H, Castanera R, Alfaro M, Ramirez L, Pisabarro AG, Riley R, Kuo A, Andreopoulos W, LaButti K, Pangilinan J, Tritt A, Lipzen A, He G, Yan M, Ng V, Grigoriev IV, Cullen D, Martin F, Rosso MN, Henrissat B, Hibbett D, Martinez AT. Mol Biol Evol in press PMID:33211093
  5. Microbiota-directed fibre activates both targeted and secondary metabolic shifts in the distal gut (2020) Michalak L, Gaby JC, Lagos L, La Rosa SL, Hvidsten TR, Tetard-Jones C, Willats WGT, Terrapon N, Lombard V, Henrissat B, Droge J, Arntzen MO, Hagen LH, Overland M, Pope PB, Westereng B. Nature Commun. 11 5773 PMID:33188211
  6. Investigating the multi-modularity of a GH10 xylanase found in termite gut metagenome (2020) Wu H, Ioannou E, Henrissat B, Montanier CY, Bozonnet S, O'Donohue MJ, Dumon C. Appl. Environ. Microbiol. in press PMID:33187992
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Pedro M COUTINHO
Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
Bastian HORNUNG
UNK
Insaf KHERBANI
Vincent LOMBARD
Nicolas TERRAPON

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