CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

Accueil du site > fr > Recherche > Les équipes > Glycogénomique

Glycogénomique

Responsable Bernard HENRISSAT

Dernières Publications

  1. A fibrolytic potential in the human ileum mucosal microbiota revealed by functional metagenomic. (2017) Patrascu O, Beguet-Crespel F, Marinelli L, Le Chatelier E, Abraham AL, Leclerc M, Klopp C, Terrapon N, Henrissat B, Blottiere HM, Dore J, Bera-Maillet C. Sci Rep 7 40248 PMID:28091525
  2. Comparative genomics of Mortierella elongata and its bacterial endosymbiont Mycoavidus cysteinexigens. (2017) Uehling J, Gryganskyi A, Hameed K, Tschaplinski T, Misztal PK, Wu S, Desiro A, Vande Pol N, Du Z, Zienkiewicz A, Zienkiewicz K, Morin E, Tisserant E, Splivallo R, Hainaut M, Henrissat B, Ohm R, Kuo A, Yan J, Lipzen A, Nolan M, LaButti K, Barry K, Goldstein AH, Labbe J, Schadt C, Tuskan G, Grigoriev I, Martin F, Vilgalys R, Bonito G. Environ Microbiol in press PMID:28076891
  3. Characterization of four endophytic fungi as potential consolidated bioprocessing hosts for conversion of lignocellulose into advanced biofuels. (2017) Wu W, Davis RW, Tran-Gyamfi MB, Kuo A, LaButti K, Mihaltcheva S, Hundley H, Chovatia M, Lindquist E, Barry K, Grigoriev IV, Henrissat B, Gladden JM. Appl Microbiol Biotechnol in press PMID:28078400
  4. The chimeric nature of the genomes of marine magnetotactic coccoid-ovoid bacteria defines a novel group of Proteobacteria. (2017) Ji B, Zhang SD, Zhang WJ, Rouy Z, Alberto F, Santini CL, Mangenot S, Gagnot S, Philippe N, Pradel N, Zhang L, Tempel S, Li Y, Medigue C, Henrissat B, Coutinho PM, Barbe V, Talla E, Wu LF. Environ Microbiol in press PMID:27902881
  5. Structural insights into a family 39 glycoside hydrolase from the gut symbiont Bacteroides cellulosilyticus WH2 (2017) Ali-Ahmad A, Garron ML, Zamboni V, Lenfant N, Nurizzo D, Henrissat B, Berrin JG, Bourne Y, Vincent F. J Struct Biol in press PMID:27890857
  6. Broad phylogeny and functionality of cellulosomal components in the bovine rumen microbiome. (2017) Bensoussan L, Morais S, Dassa B, Friedman N, Henrissat B, Lombard V, Bayer EA, Mizrahi I. Environ Microbiol in press PMID:27712009
...Toutes nos publications

Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Matthieu HAINAUT
Bernard HENRISSAT
UNK
Denise HENRISSAT
Pascal LAPEBIE
Vincent LOMBARD
Pedro MALDONADO COUTINHO
Rajender KUMAR
Nicolas TERRAPON

© AFMB UMR7257  W3C validation