CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Bernard HENRISSAT

Dernières Publications

  1. Metagenomic Assembly and Prokaryotic Metagenome-Assembled Genome Sequences from the Northern Gulf of Mexico "Dead Zone". (2018) Thrash JC, Baker BJ, Seitz KW, Temperton B, Campbell LG, Rabalais NN, Henrissat B, Mason OU. Microbiol Resour Announc 7 pii: e01033-18 PMID:30533941
  2. Proteomic dissection of the cellulolytic machineries used by soil-dwelling Bacteroidetes (2018) Taillefer M, Arntzen MO, Henrissat B, Pope PB, Larsbrink J. mSystems 3 pii: e00240-18 PMID:30505945
  3. Nuclear genome sequence of the plastid-lacking cryptomonad Goniomonas avonlea provides insights into the evolution of secondary plastids. (2018) Cenci U, Sibbald SJ, Curtis BA, Kamikawa R, Eme L, Moog D, Henrissat B, Marechal E, Chabi M, Djemiel C, Roger AJ, Kim E, Archibald JM. BMC Biol 16 137 PMID:30482201
  4. Pezizomycetes genomes reveal the molecular basis of ectomycorrhizal truffle lifestyle. (2018) Murat C, Payen T, Noel B, Kuo A, Morin E, Chen J, Kohler A, Krizsan K, Balestrini R, Da Silva C, Montanini B, Hainaut M, Levati E, Barry KW, Belfiori B, Cichocki N, Clum A, Dockter RB, Fauchery L, Guy J, Iotti M, Le Tacon F, Lindquist EA, Lipzen A, Malagnac F, Mello A, Molinier V, Miyauchi S, Poulain J, Riccioni C, Rubini A, Sitrit Y, Splivallo R, Traeger S, Wang M, Zifcakova L, Wipf D, Zambonelli A, Paolocci F, Nowrousian M, Ottonello S, Baldrian P, Spatafora JW, Henrissat B, Nagy LG, Aury JM, Wincker P, Grigoriev IV, Bonfante P, Martin FM. Nat Ecol Evol 2 1956-1965 PMID:30420746
  5. The obligate alkalophilic soda-lake fungus Sodiomyces alkalinus has shifted to a protein diet. (2018) Grum-Grzhimaylo AA, Falkoski DL, van den Heuvel J, Valero-Jimenez CA, Min B, Choi IG, Lipzen A, Daum CG, Aanen DK, Tsang A, Henrissat B, Bilanenko EN, de Vries RP, van Kan JAL, Grigoriev IV, Debets AJM. Mol Ecol in press PMID:30368956
  6. Analysis of carbohydrate-active enzymes in Thermogemmatispora sp. strain T81 reveals carbohydrate degradation ability. (2018) Tomazini A Jr, Lal S, Munir R, Stott M, Henrissat B, Polikarpov I, Sparling R, Levin DB. Can J Microbiol 64 1-12 PMID:30338698
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
Pascal LAPEBIE
Vincent LOMBARD
Pedro MALDONADO COUTINHO
Nicolas TERRAPON

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