CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Bernard HENRISSAT

Dernières Publications

  1. Revisiting old questions and new approaches to investigate the fungal cell wall construction (2020) Blatzer M, Beauvais A, Henrissat B, Latge JP. Curr Top Microbiol Immunol in press PMID:32418033
  2. A catalog of microbial genes from the bovine rumen unveils a specialized and diverse biomass-degrading environment (2020) Li J, Zhong H, Ramayo-Caldas Y, Terrapon N, Lombard V, Potocki-Veronese G, Estelle J, Popova M, Yang Z, Zhang H, Li F, Tang S, Yang F, Chen W, Chen B, Li J, Guo J, Martin C, Maguin E, Xu X, Yang H, Wang J, Madsen L, Kristiansen K, Henrissat B, Ehrlich SD, Morgavi DP. Gigascience 9(6) giaa057 PMID:32473013
  3. Conserved white rot enzymatic mechanism for wood decay in the Basidiomycota genus Pycnoporus (2020) Miyauchi S, Hage H, Drula E, Lesage-Meessen L, Berrin JG, Navarro D, Favel A, Chaduli D, Grisel S, Haon M, Piumi F, Levasseur A, Lomascolo A, Ahrendt S, Barry K, LaButti KM, Chevret D, Daum C, Mariette J, Klopp C, Cullen D, de Vries RP, Gathman AC, Hainaut M, Henrissat B, Hilden KS, Kues U, Lilly W, Lipzen A, Makela MR, Martinez AT, Morel-Rouhier M, Morin E, Pangilinan J, Ram AFJ, Wosten HAB, Ruiz-Duenas FJ, Riley R, Record E, Grigoriev IV, Rosso MN. DNA Res in press PMID:32531032
  4. Infection cushions of Fusarium graminearum are fungal arsenals for wheat infection (2020) Mentges M, Glasenapp A, Boenisch M, Malz S, Henrissat B, Frandsen RJN, Guldener U, Munsterkotter M, Bormann J, Lebrun MH, Schafer W, Martinez-Rocha AL. Mol Plant Pathol in press PMID:32573086
  5. Genome sequencing of Rigidoporus microporus provides insights on genes important for wood decay, latex tolerance and interspecific fungal interactions. (2020) Oghenekaro OA, Kovalchuk A, Raffaello T, Camarero S, Gressler M, Henrissat B, Lee J, Liu M, Martinez AT, Miettinen O, Mihaltcheva S, Pangilinan J, Ren F, Riley R, Ruiz-Duenasc FJ, Serrano A, Thon MR, Wen Z, Zeng Z, Barry K, Grigoriev IV, Martin F, Asiegbu FO. Sci. Rep. 10 5250 PMID:32251355
  6. 101 Dothideomycetes genomes: a test case for predicting lifestyles and emergence of pathogens. (2020) Haridas S, R. Binder AM, Bloem J, LaButti K, Salamov A, Andreopoulos B, Baker SE, Barry K, Bills G, Bluhm BH , Cannon C, Castanera R, Culley DE, Daum C, Ezra D, Gonzalez JB, Henrissat B, Kuo A, Liang C, Lipzen A, Lutzoni F, Magnuson J, Mondo SJ, Nolan M, Ohm RA, Pangilinan J, Park HJ, Ramirez L, Alfaro M, Sun H, Tritt A, Yoshinaga Y, Zwiers LH, Turgeon BG, Goodwin SB, Spatafora JW, Crous PW, Grigoriev IV. Studies Mycol. 96 141-153 PMID:32206138
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Pedro M COUTINHO
Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
UNK
Bastian HORNUNG
Aurore LABOUREL
Vincent LOMBARD
Nicolas TERRAPON

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