CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Bernard HENRISSAT

Dernières Publications

  1. 101 Dothideomycetes genomes: a test case for predicting lifestyles and emergence of pathogens. (2020) Haridas S, R. Binder AM, Bloem J, LaButti K, Salamov A, Andreopoulos B, Baker SE, Barry K, Bills G, Bluhm BH , Cannon C, Castanera R, Culley DE, Daum C, Ezra D, Gonzalez JB, Henrissat B, Kuo A, Liang C, Lipzen A, Lutzoni F, Magnuson J, Mondo SJ, Nolan M, Ohm RA, Pangilinan J, Park HJ, Ramirez L, Alfaro M, Sun H, Tritt A, Yoshinaga Y, Zwiers LH, Turgeon BG, Goodwin SB, Spatafora JW, Crous PW, Grigoriev IV. Studies Mycol. 96 141-153 PMID:0
  2. A comparative genomics study of 23 Aspergillus species from section Flavi. (2020) Kjaerbolling I, Vesth T, Frisvad JC, Nybo JL, Theobald S, Kildgaard S, Petersen TI, Kuo A, Sato A, Lyhne EK, Kogle ME, Wiebenga A, Kun RS, Lubbers RJM, Makela MR, Barry K, Chovatia M, Clum A, Daum C, Haridas S, He G, LaButti K, Lipzen A, Mondo S, Pangilinan J, Riley R, Salamov A, Simmons BA, Magnuson JK, Henrissat B, Mortensen UH, Larsen TO, de Vries RP, Grigoriev IV, Machida M, Baker SE, Andersen MR. Nat Commun 11 1106 PMID:32107379
  3. A Mutation Map for Human Glycoside Hydrolase Genes. (2020) Hansen L, Husein DM, Gericke B, Hansen T, Pedersen O, Tambe MA, Freeze HH, Naim HY, Henrissat B, Wandall HH, Clausen H, Bennett EP. Glycobiology in press PMID:32039448
  4. Discovery of a fungal copper radical oxidase with high catalytic efficiency towards 5-hydroxymethylfurfural and benzyl alcohols for bioprocessing (2020) Mathieu Y, Offen WA, Forget SM, Ciano L, Viborg AH, Blagova E, Henrissat B, Walton PH, Davies GJ, Brumer H. ACS Catal. 10(5) 3042-3058 PMID:0
  5. Metabolism of multiple glycosaminoglycans by Bacteroides thetaiotaomicron is orchestrated by a versatile core genetic locus. (2020) Ndeh D, Basle A, Strahl H, Yates EA, McClurgg UL, Henrissat B, Terrapon N, Cartmell A. Nat Commun 11 646 PMID:32005816
  6. A fungal family of lytic polysaccharide monooxygenase-like copper proteins. (2020) Labourel A, Frandsen KEH, Zhang F, Brouilly N, Grisel S, Haon M, Ciano L, Ropartz D, Fanuel M, Martin F, Navarro D, Rosso MN, Tandrup T, Bissaro B, Johansen KS, Zerva A, Walton PH, Henrissat B, Leggio LL, Berrin JG. Nat Chem Biol 16 345-350 PMID:31932718
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Pedro M COUTINHO
Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
UNK
Bastian HORNUNG
Aurore LABOUREL
Vincent LOMBARD
Nicolas TERRAPON

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