CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Nicolas TERRAPON

Dernières Publications

  1. Secreted pectin monooxygenases drive plant infection by pathogenic oomycetes (2021) Sabbadin F, Urresti S, Henrissat B, Avrova AO, Welsh LRJ, Lindley PJ, Csukai M, Squires JN, Walton PH, Davies GJ, Bruce NC, Whisson SC, McQueen-Mason SJ. Science 373 774-779 PMID:34385392
  2. C-type cytochrome-initiated reduction of bacterial lytic polysaccharide monooxygenases (2021) Branch J, Rajagopal BS, Paradisi A, Yates N, Lindley PJ, Smith J, Hollingsworth K, Turnbull B, Henrissat B, Parkin A, Berry A, Hemsworth GR. Biochem. J. 478(14) 2927-2944 PMID:34240737
  3. Symbiotic nitrogen fixation in the reproductive structures of a basidiomycete fungus (2021) Koch RA, Yoon GM, Aryal UK, Lail K, Amirebrahimi M, LaButti K, Lipzen A, Riley R, Barry K, Henrissat B, Grigoriev IV, Herr JR, Aime MC. Curr. Biol. 31(17) 3905-3914 PMID:34245690
  4. Evaluating microbiome-directed fibre snacks in gnotobiotic mice and humans (2021) Delannoy-Bruno O, Desai C, Raman AS, Chen RY, Hibberd MC, Cheng J, Han N, Castillo JJ, Couture G, Lebrilla CB, Barve RA, Lombard V, Henrissat B, Leyn SA, Rodionov DA, Osterman AL, Hayashi DK, Meynier A, Vinoy S, Kirbach K, Wilmot T, Heath AC, Klein S, Barratt MJ, Gordon JI. Nature 595 91-95 PMID:34163075
  5. Display of the human mucinome with defined O-glycans by gene engineered cells (2021) Nason R, Bull C, Konstantinidi A, Sun L, Ye Z, Halim A, Du W, Sorensen DM, Durbesson F, Furukawa S, Mandel U, Joshi HJ, Dworkin LA, Hansen L, David L, Iverson TM, Bensing BA, Sullam PM, Varki A, Vries E, de Haan CAM, Vincentelli R, Henrissat B, Vakhrushev SY, Clausen H, Narimatsu Y. Nat Commun 12(1) 4070 PMID:34210959
  6. Polysaccharide utilization loci-driven enzyme discovery reveals BD-FAE: a bifunctional feruloyl and acetyl xylan esterase active on complex natural xylans (2021) Hameleers L, Penttinen L, Ikonen M, Jaillot L, Faure R, Terrapon N, Deuss PJ, Hakulinen N, Master ER, Jurak E. Biotechnol Biofuels 14 127 PMID:34059129
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Pedro M COUTINHO
Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
Bastian HORNUNG
Vincent LOMBARD
Nicolas TERRAPON

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