CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Bernard HENRISSAT

Dernières Publications

  1. Pezizomycetes genomes reveal the molecular basis of ectomycorrhizal truffle lifestyle. (2018) Murat C, Payen T, Noel B, Kuo A, Morin E, Chen J, Kohler A, Krizsan K, Balestrini R, Da Silva C, Montanini B, Hainaut M, Levati E, Barry KW, Belfiori B, Cichocki N, Clum A, Dockter RB, Fauchery L, Guy J, Iotti M, Le Tacon F, Lindquist EA, Lipzen A, Malagnac F, Mello A, Molinier V, Miyauchi S, Poulain J, Riccioni C, Rubini A, Sitrit Y, Splivallo R, Traeger S, Wang M, Zifcakova L, Wipf D, Zambonelli A, Paolocci F, Nowrousian M, Ottonello S, Baldrian P, Spatafora JW, Henrissat B, Nagy LG, Aury JM, Wincker P, Grigoriev IV, Bonfante P, Martin FM. Nat Ecol Evol in press PMID:30420746
  2. The obligate alkalophilic soda-lake fungus Sodiomyces alkalinus has shifted to a protein diet. (2018) Grum-Grzhimaylo AA, Falkoski DL, van den Heuvel J, Valero-Jimenez CA, Min B, Choi IG, Lipzen A, Daum CG, Aanen DK, Tsang A, Henrissat B, Bilanenko EN, de Vries RP, van Kan JAL, Grigoriev IV, Debets AJM. Mol Ecol in press PMID:30368956
  3. Analysis of carbohydrate-active enzymes in Thermogemmatispora sp. strain T81 reveals carbohydrate degradation ability. (2018) Tomazini A Jr, Lal S, Munir R, Stott M, Henrissat B, Polikarpov I, Sparling R, Levin DB. Can J Microbiol in press 1-12 PMID:30338698
  4. A surface endogalactanase in Bacteroides thetaiotaomicron confers keystone status for arabinogalactan degradation. (2018) Cartmell A, Munoz-Munoz J, Briggs JA, Ndeh DA, Lowe EC, Basle A, Terrapon N, Stott K, Heunis T, Gray J, Yu L, Dupree P, Fernandes PZ, Shah S, Williams SJ, Labourel A, Trost M, Henrissat B, Gilbert HJ. Nat Microbiol 3 1314-1326 PMID:30349080
  5. Investigation of inter- and intraspecies variation through genome sequencing of Aspergillus section Nigri. (2018) Vesth TC, Nybo JL, Theobald S, Frisvad JC, Larsen TO, Nielsen KF, Hoof JB, Brandl J, Salamov A, Riley R, Gladden JM, Phatale P, Nielsen MT, Lyhne EK, Kogle ME, Strasser K, McDonnell E, Barry K, Clum A, Chen C, LaButti K, Haridas S, Nolan M, Sandor L, Kuo A, Lipzen A, Hainaut M, Drula E, Tsang A, Magnuson JK, Henrissat B, Wiebenga A, Simmons BA, Makela MR, de Vries RP, Grigoriev IV, Mortensen UH, Baker SE, Andersen MR. Nat Genet in press PMID:30349117
  6. From proteins to polysaccharides: lifestyle and genetic evolution of Coprothermobacter proteolyticus. (2018) Kunath BJ, Delogu F, Naas AE, Arntzen MO, Eijsink VGH, Henrissat B, Hvidsten TR, Pope PB. ISME J in press PMID:30315317
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
Pascal LAPEBIE
Vincent LOMBARD
Pedro MALDONADO COUTINHO
Nicolas TERRAPON

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