CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Bernard HENRISSAT

Dernières Publications

  1. Effects of microbiota-directed foods in gnotobiotic animals and undernourished children. (2019) Gehrig JL, Venkatesh S, Chang HW, Hibberd MC, Kung VL, Cheng J, Chen RY, Subramanian S, Cowardin CA, Meier MF, O'Donnell D, Talcott M, Spears LD, Semenkovich CF, Henrissat B, Giannone RJ, Hettich RL, Ilkayeva O, Muehlbauer M, Newgard CB, Sawyer C, Head RD, Rodionov DA, Arzamasov AA, Leyn SA, Osterman AL, Hossain MI, Islam M, Choudhury N, Sarker SA, Huq S, Mahmud I, Mostafa I, Mahfuz M, Barratt MJ, Ahmed T, Gordon JI. Science 365 (6449) pii: eaau4732 PMID:31296738
  2. Investigating Host Microbiota Relationships Through Functional Metagenomics. (2019) Laville E, Perrier J, Bejar N, Maresca M, Esque J, Tauzin AS, Bouhajja E, Leclerc M, Drula E, Henrissat B, Berdah S, Di Pasquale E, Robe P, Potocki-Veronese G. Front Microbiol 10 1286 PMID:31275257
  3. Comparative genomics reveals unique wood-decay strategies and fruiting body development in the Schizophyllaceae. (2019) Almasi E, Sahu N, Krizsan K, Balint B, Kovacs GM, Kiss B, Cseklye J, Drula E, Henrissat B, Nagy I, Chovatia M, Adam C, LaButti K, Lipzen A, Riley R, Grigoriev IV, Nagy LG. New Phytol in press PMID:31257601
  4. Evolution and comparative genomics of the most common Trichoderma species. (2019) Kubicek CP, Steindorff AS, Chenthamara K, Manganiello G, Henrissat B, Zhang J, Cai F, Kopchinskiy AG, Kubicek EM, Kuo A, Baroncelli R, Sarrocco S, Noronha EF, Vannacci G, Shen Q, Grigoriev IV, Druzhinina IS. BMC Genomics 20 485 PMID:31189469
  5. Tracking of enzymatic biomass deconstruction by fungal secretomes highlights markers of lignocellulose recalcitrance. (2019) Paes G, Navarro D, Benoit Y, Blanquet S, Chabbert B, Chaussepied B, Coutinho PM, Durand S, Grigoriev IV, Haon M, Heux L, Launay C, Margeot A, Nishiyama Y, Raouche S, Rosso MN, Bonnin E, Berrin JG. Biotechnol Biofuels 12 76 PMID:30976326
  6. Poplar carbohydrate-active enzymes - whole genome annotation and functional analyses based on RNA expression data. (2019) Kumar V, Hainaut M, Delhomme N, Mannapperuma C, Immerzeel P, Street NR, Henrissat B, Mellerowicz EJ. Plant J in press PMID:31111606
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
Aurore LABOUREL
Vincent LOMBARD
Pedro MALDONADO COUTINHO
Nicolas TERRAPON

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