CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257

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Glycogénomique

Responsable Nicolas TERRAPON

Dernières Publications

  1. Functional diversity of three tandem C-terminal carbohydrate-binding modules of a b-mannanase (2021) Moeller MS, El Bouaballati S, Henrissat B, Svensson B. J. Biol. Chem. in press PMID:33838183
  2. Discovery of fungal oligosaccharide-oxidising flavo-enzymes with previously unknown substrates, redox-activity profiles and interplay with LPMOs (2021) Haddad Momeni M, Fredslund F, Bissaro B, Raji O, Vuong TV, Meier S, Nielsen TS, Lombard V, Guigliarelli B, Biaso F, Haon M, Grisel S, Henrissat B, Welner DH, Master ER, Berrin JG, Abou Hachem M. Nat. Commun. 12(1) 2132 PMID:33837197
  3. Clinical evidence of the role of Methanobrevibacter smithii in severe acute malnutrition (2021) Camara A, Konate S, Tidjani Alou M, Kodio A, Togo AH, Cortaredona S, Henrissat B, Thera MA, Doumbo OK, Raoult D, Million M. Sci Rep 11(1) 5426 PMID:33686095
  4. Strain-level functional variation in the human gut microbiota based on bacterial binding to artificial food particles (2021) Patnode ML, Guruge JL, Castillo JJ, Couture GA, Lombard V, Terrapon N, Henrissat B, Lebrilla CB, Gordon JI. Cell Host Microbe in press PMID:33571448
  5. Gene family expansions and transcriptome signatures uncover fungal adaptations to wood decay (2021) Hage H, Miyauchi S, Viragh M, Drula E, Min B, Chaduli D, Navarro D, Favel A, Norest M, Lesage-Meessen L, Balint B, Merenyi Z, de Eugenio L, Morin E, Martinez AT, Baldrian P, Stursova M, Martinez MJ, Novotny C, Magnuson JK, Spatafora JW, Maurice S, Pangilinan J, Andreopoulos W, LaButti K, Hundley H, Na H, Kuo A, Barry K, Lipzen A, Henrissat B, Riley R, Ahrendt S, Nagy LG, Grigoriev IV, Martin F, Rosso MN. Environ Microbiol in press PMID:33538380
  6. Characterization of three bacterial glycoside hydrolase family 9 endoglucanases with different modular architectures isolated from a compost metagenome (2021) Ayme L, Hebert A, Henrissat B, Lombard V, Franche N, Perret S, Jourdier E, Heiss-Blanquet S. Biochim Biophys Acta Gen Subj 1865 129848 PMID:33460770
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Notre équipe tente d’établir et d’explorer les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. Ces travaux nous conduisent dans des domaines aussi divers que l’exploration du microbiote intestinal, la recherche d’enzymes pour l’élaboration de biocarburants ou pour la conversion des groupes sanguins.

CAZy et la classification des CAZymes

Les glucides sont utilisés par les êtres vivants pour une multitude de rôles, de la simple source de carbone, à celui de signaux moléculaires spécifiques, au rôle de structure, de stockage de l’énergie, ou encore lors des interactions hôtes-pathogènes. Nous nommons CAZymes les enzymes qui assemblent et déconstruisent les sucres complexes et les polysaccharides. Contrairement à la plupart des autres classes d’enzymes qui portent peu de puissance informationnelle, les particularités des CAZymes et de leurs substrats en font des outils puissants pour examiner et expliquer le style de vie des organismes vivants. Au cours des vingt dernières années, nous avons développé une classification en familles qui corrèle avec la structure et le mécanisme catalytique des CAZymes. Cette classification couvre à l’heure actuelle 5 classes d’enzymes (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et activités auxiliaires) ainsi que les modules de fixation aux sucres qui caractérisent bon nombres de CAZymes. Afin de mettre à disposition de la communauté notre classification, nous avons créé la base de données en ligne CAZy (www.cazy.org) que nous mettons à jour régulièrement depuis 1998. Depuis quelques années nous couplons les moyens bioinformatiques à notre base de données afin d’explorer le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes.


Pedro M COUTINHO
Elodie DRULA
Marie-Line GARRON
Bernard HENRISSAT
Bastian HORNUNG
UNK
Insaf KHERBANI
Vincent LOMBARD
Nicolas TERRAPON

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