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Les protéines des virus des crénarchées

mardi 28 février 2012, par Miguel ORTIZ-LOMBARDIA

Traductions disponibles [English] [français]

Les virus des archées sont connus depuis le début des années 1970. Pourtant, ils n’ont été étudiés en détail que très récemment.Ces virus sont particulièrement intéressants du point de vue évolutif, car leurs hôtes ont des caractéristiques qui les font ressembler à la fois les bactéries et les eucaryotes. Les cellules des archées ressemblant celles des bactéries, on s’attendrait donc à ce que leurs virus ressemblent aux bactériophages. C’est le cas pour la plupart des virus infectant le phylum des euryarchées, mais pas pour ceux des crénarchées. En surprenant contraste avec leur intérêt du point de vue de l’évolution, la biologie des virus des crénarchées demeure largement inconnue. Cette situation reflète le fait que le 50% - 90% des cadres ouverts de lecture (ORF) identifiés dans le génome de ces virus n’ont pas de fonction connue ou présumée.


collaborations :
- actuelles : Prof. Roger Garret, Danish Archaea Centre, Copenhague, Danemark
- terminées : Dr. David Prangishvili, Institut Pasteur, Paris, France ; Herman van Tilbeurgh, Université d’Orsay, Orsay, France.


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AFV1 capsid proteins

Le projet VIRAR, financé par l’ANR, nous a permis d’entamer l’étude de la biologie structurale de ces virus, en collaboration avec D. Prangishvili et Herman van Tilbeurgh. Suite à ces travaux, nous avons résolu la structure de six protéines de ces virus, dont trois protéines structurales, une nucléase et deux protéines dont la fonction reste inconnue. La structure cristalline des deux protéines principales de la capside du lipothrixvirus AFV1 (PMID:19934032) [1] nous a permis de suggérer un modèle sur l’architecture du virion.

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Structure of ATV-131

Plus récemment nous nous sommes intéressés à l’« Acidianus two-tailed virus » (ATV ATV Acidianus two-tailed Virus ), qui fut initialement découvert en 2003 à Pozzuoli, en Italie. Ce virus a été isolé d’une source à des températures supérieures à 85 ºC et à un pH de 1,5, où habite son hôte, la crénarchée Acidianus convivator. Exceptionnellement pour un virus, le virus ATV ATV Acidianus two-tailed Virus subit une métamorphose extracellulaire : entre une heure et quelques jours après la lyse, deux queues se développent de manière irréversible à chaque extrémité des virions. Ce processus dépend seulement de la température, qui doit être proche de celle de l’habitat de l’hôte. Nous avons résolu la structure de deux protéines de ce virus, dont une protéine structurale qui pourrait aussi lier l’ADN ADN Acide Désoxyribo-Nucléique et un autre possiblement impliquée en la croissance des queues.

Collaborations

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Université d’Orsay
15 Rue Georges Clemenceau
91400 Orsay France
http://www.u-psud.fr/
University of Copenhagen
Nørregade 10
DK-1165 Copenhagen K

lieux


Notes


[1] Goulet A, Blangy S, Redder P, Prangishvili D, Felisberto-Rodrigues C, Forterre P, Campanacci V, Cambillau C (2009) Proc Natl Acad Sci U S A 106 21155-60

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