UMR7257 : CNRS - AIX MARSEILLE UNIV
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Equipes de Recherche
Les équipes
Chimie Médicinale Antivirale
Chimie Médicinale Antivirale
L’équipe KA
Identification et optimisation d’inhibiteurs par une approche de « Fragment-based drug discovery » : application aux domaines NS3 et NS5 de Flavivirus
Trouver de nouveaux analogues de nucléotides pour contourner la résistance de la RT du HIV aux drogues de type nucléosi(ti)dique.
Optimisation de « hits » obtenus par criblage de la polymérase NS5 du virus de la dengue
Des dinucléotides modifiés comme inhibiteurs de la polymérase NS5B du virus de l’hépatite C
Désordre structural et reconnaissance moléculaire
Partenariat moléculaire du domaine C-terminal
NTAIL
intrinsèquement désordonné du virus de la Rougeole
L’Equipe SL
Désordre structural et partenariat moléculaire des régions intrinsèquement désordonnées de la nucléoprotéine et de la phosphoprotéine des Henipavirus
Les publications de l’équipe SL
Bases moléculaires de la spécificité et affinité dans la reconnaissance de partenaires par les protéines intrinsèquement désordonnées (PIDs)
Développement de MeDor, un metaserveur pour la prédiction du désordre chez les protéines
Désordre structural et reconnaissance moléculaire
Glycobiologie et Neurobiologie Structurales
Glycobiologie et Neurobiologie Structurales
Composition de l’équipe
Glycogénomique
Glycogénomique
L’équipe de Glycogénomique
CAZy
Immunologie Structurale
Immunologie Structurale
Mécanismes moléculaires de l’activation du récepteur Toll de Drosophile
L’équipe AR
Activation et régulation des voies Imd et JAK/STAT de Drosophile
Etude de la protéase TSSP et de son rôle dans le diabète
Réplicases Virales : Structure, Mécanisme et Drug-Design
Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design
Etude des ARN polymérases ARN-dépendantes
Etudes des enzymes de formation de la coiffe des ARN ou « RNA capping »
Etudes des enzymes associées au complexe de réplication
Outils & approches multidisciplinaires
Production de protéines recombinantes
Plateforme de criblage « PCML » et « AD2P »
L’Equipe
Transport Moléculaire et Signalisation
Transport Moléculaire et Signalisation
Présentation de l’équipe
Les systèmes de sécrétion bactériens
Les baseplates des phages des bactéries à Gram+ et leur fonction pendant l’infection
Les protéines des virus des crénarchées
Le contrôle de la transcription par les protéines Hox
Les protéines de l’olfaction chez les insectes
Le Laboratoire
L’AFMB en détail
Adresse
Organigramme
Annuaire du personnel
Publications
Les Collaborations
Les Tutelles
Communication
Cours pratique sur la production à haut débit de protéines recombinantes pour les complexes Protéine-Protéine et Protéine-Acide Nucléique
Fête de la Science 2011
Mentions légales
Membres
Pascale Marchot, équipe “Glycobiologie et Neurobiologie Structurales”
Enseignement
HDRs
Caracterisation biochimique et structurale de la polymerase du virus de l’hepatite C.
Contribution a l’étude des complexes de réplication de virus.
Contribution à la biologie structurale des archées et de leurs virus
Contribution à la découverte et au développement de composés actifs contre des polymérases virales
Contributions à l’étude des virus ARN à brin positif
Etudes structurales et fonctionnelles des protéines du complexe réplicatif du virus de la rougeole
Histoires de Phages
Titres et travaux scientifiques
Thèses d’Université
Etude structurale de protéines de virus à ARN positif impliquées dans la réplication virale et la réponse cellulaire à l’infection
Alpha-Amylases de Mammifères et d’insectes. Relations Structure/Fonction
Analyse de l’interaction entre les protéines au travers de la résolution de leur structure tridimensionnelle : application au cas de deux neurotoxines
Analyse structurale de l’inhibition de l’α-amylase pancréatique de porc isoenzyme II
Analyses conformationnelles par spectroscopie RMN de neurotoxines de scorpion, d’une glutaredoxine et d’une chémokine
Annotation et prédiction de la spécificité de substrat des enzymes actives sur les sucres
Approches bioinformatiques et structurales des réplicases virales
Bases structurales de l’interaction entre la nucléoprotéine du virus de la rougeole et ses partenaires viraux et cellulaires
Bases structurales de la spécificité de reconnaissance entre les toxines animales et les canaux ioniques
Bases structurales et fonctionnelle de l’inhibition de la transcriptase inverse du VIH
Biochemical, biophysical and structural characterisation of Lactococcus lactis bacteriophages structural proteins
Caractérisation Structurale et Fonctionnelle de Protéines de Virus d’Archées Extrêmophiles : des Repliements Originaux et une Nouvelle Lignée Virale.
Contribution de la biotechnologie à la virologie structurale et fonctionnelle
Cristallisation des protéines : étude de paramètres critiques systématique
Crystallographic and mutagenesis studies of tRNA-guanine transglycosylase
Dynamique Structurale de la Nitrite Réductase de Pseudomonas aeruginosa, le Long du Chemin Réactionnel
Etude cristallographique de l’interaction entre une lectine végétale (Lanthyrus ochrus) et divers saccharides
Étude d’enzymes de modification d’ARN impliquées dans la réplication des flavivirus et des coronavirus
Etude des relations structure-fonction de glycosyltransferases impliquées dans la biogenèse du peptidoglycane bactérien
Etude structurale de l’endoglucanase A de Clostridum cellulolyticum
Etude Structurale de la protéine HasA, un hémophore impliqué dans une voie originale d’acquisition du fer
Etude structurale des protéines du complexe réplicatif du virus de la rougeole
Etude structurale et fonctionnelle de la protéine PGRP-LF impliquée dans la régulation négative de la voie IMD chez la Drosophile.
Etude structurale et fonctionnelle de protéines de virus à ARN impliquées dans la réplication virale et la réponse cellulaire à l’infection
Etudes cristallographiques d’Enzymes psychrophiles : Relations Structure / Fonction et Adaptation au froid
Etudes cristallographiques du système Lipase Pancréatique Humaine-Colipase et d’une protéine de transport d’acides gras
Etudes fonctionnelles et structurales d’ASP1, une protéine de liaison des phéromones chez l’abeille.
Etudes Fonctionnelles et structurales de protéines d’insectes impliquées dans le transport de phéromones ou de chemo-effecteurs
Etudes structurale et fonctionnelle de deux enzymes impliquées dans le métabolisme des sucres chez les bactéries
Etudes structurale et Fonctionnelles de protéines transporteuses d’Odeurs et de Phéromones chez les Mammifères
Etudes structurales de protéines impliquées dans la réponse immunitaire innée des insectes
Etudes structurales et fonctionnelles de deux alpha-galactosidases actives sur les antigènes B et alpha3Gal
Etudes structurales et fonctionnelles de deux beta-agarases de la famille 16 des glycoside-hydrolases
Etudes Structurales et fonctionnelles de deux enzymes cles impliquées dans la biosynthèse de l’UDP-N-Acetyl-Glucosamine chez les Eucaryotes
Etudes structurales et fonctionnelles de protéines impliquées dans l’olfaction des insectes
Etudes structurales par RMN de deux types de molécules : Les neurotoxines courtes de scorpions et les anticorps de camélidés.
Etudes structure-fonction d’une cutinase recombinante de Fusarium solani pisi
Evolution et prédiction des activités des glycoside hydrolases
Expression, purification and biophysical characterisation of mammalian GPCRs for structural studies.
Flexibilité au sein de la nucléoprotéine et de la phosphoprotéine des Paramyxovirus : Prédiction, caractérisation expérimentale et repliement induit
Immobilisation de biomolécules sur des surfaces conductrices
L’extrémité 5’ de l’ARNm du virus de la Dengue : Trois enzymes et une coiffe
La machinerie de sécrétion de type II Xcp de Pseudomonas aeruginosa : relations structure-fonction et interactome
La polymérase du virus de l’Hépatite C : des inhibiteurs et des structures
La Sérendipité en Sciences, illustrations avec les études d’une enzyme dégradant les insecticides et d’une nouvelle protéine humaine
Mécanismes de suppression de la résistance de la transcriptase inverse du VIH 1 aux analogues de nucléotides
Production de protéines recombinantes à haut débit : Application aux facteurs de transcription de Ciona intestinalis
Réalisation d’outils logiciels pour la biologie structurale application à la résolution de structures par résonance magnétique nucléaire bidimensionnelle
Réalisation d’outils logiciels pour la cristallographie des macromolécules biologiques
Structural and biophysical studies of virion proteins from Acidianus two-tailed virus
Structural studies of Siphoviridae by hybrid methods yield insights into bacteriophage, assembly, infection, inhibition and evolution
Structuration et exploration d’information génomique et fonctionnelle des enzymes actives sur les glucides.
Structure cristalline a 1,6 Angstroems de résolution d’une cutinase recombinante de Fusarium solani pisi
Structure Cristalline à 1.9 Å de résolution d’un complexe protéine-protéine entre une α-amylase d’orge et un inhibiteur bifonctionnel
Structure en solution de neurotoxines de scorpions : Vers un nouveau modèle d’interaction toxine/canal potassium
Structure par Résonance Magnétique nucléaire de toxines, effecteurs de canaux ioniques : l’anisotropie électrostatique est-elle un facteur déterminant pour leur interaction ?
Structure par RMN de ligands de canaux ioniques et modélisation de leur interaction.
Structure par RMN des protéines. Vers une compréhension moléculaire de leur fonction
Tenothiovir et Adethiovir : nouveaux analogues phosphonates acycliques pour cibler les VIH-1 resistants.
Un complexe ARN-peptide révèle des mécanismes de co-stabilisation entre ARN et peptide
Plateformes
Clonage, expression, purification de protéines recombinantes
Diffusion de la lumière à plusieurs angles (MALS/SEC)
Plateforme de Criblage Marseille-Luminy
Résonance plasmonique de surface
Titration Calorimétrique Isotherme
Actualités
Changement d’identifiant
Cours pratique sur la production à haut débit de protéines recombinantes pour les complexes Protéine-Protéine et Protéine-Acide Nucléique
Déstabiliser les structures secondaires des ARNm au niveau du site de fixation du ribosome (RBS) peut améliorer les niveaux d’expression dans
E. coli
.
Karine Alvarez, Médaille de Bronze CNRS
“To Fold or to Refold ?” Une question shakespearienne appliquée aux protéines recombinantes.
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Juin 2013
Mai 2013
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