CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257


Notre laboratoire


Le laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB), sous tutelle mixte du CNRS et de AMU, est un centre de biologie structurale localisé sur le campus de Luminy dans le Sud de Marseille, France, et en partenariat avec l’INRA sous la forme d’une unité sous contrat. L’objectif de nos recherches est de décrire à l’échelle moléculaire l’architecture des protéines ou des édifices macromoléculaires pour comprendre les mécanismes biologiques qui leur sont associés. La description des interactions entre macromolécules ou entre une macromolécule et son ligand fonctionnel est aussi nécessaire pour pouvoir agir sur ces systèmes complexes. Enfin, pour comprendre la diversité moléculaire structurale et fonctionnelle des membres de certaines familles de protéines, nous analysons les données de génomique massives issues de grands centres de séquençage


Séminaires
  • Lundi 24 septembre à 11h : Andrei Lupas, Max Planck Institute for Developmental Biology, Dept. Protein Evolution, Tübingen, Allemagne "The Path from Ancestral Polypeptide Disorder to Autonomous Protein Folding (and back)"
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  • Mardi 25 septembre à 11h : Stefan Kolek, Douglas Instruments, UK "New strategies to improve productivity - rMMS microseeding for crystallization and DLS for cryoEM"

    Abstract (...)

    Abstract Random Microseed Matrix-Screening (rMMS), where seed crystals are added automatically to random crystallization screens, is a significant recent breakthrough in protein crystallization [1]. During the ten years since the method was published, understanding of the theoretical advantages of the method has increased [2 - 4], and several practical variations on the basic method have emerged. Important variations that will be discussed include combining seeds from several hits [5], the best methods of selecting hits to optimize [2], and cross-seeding targets with crystals of homologous proteins [6]. Single-particle cryoEM clearly has great potential to determine the structures of macromolecules when crystallographic approaches are not available. The throughput of cryoEM is, however, low, with only one or a few samples being analysed per day. This creates a need for a pre-screening approach to investigate the behaviour of macromolecules in solution. Douglas Instruments has worked closely with Xtal Concepts to develop a screening approach were e.g. 96 wells can be analysed by DLS using only a few microlitres of sample [8, 9]. This concept will be outlined briefly, with examples.
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Actualités
  • Ce mois d’août, les travaux de Baptiste Martin, Etienne Decroly et leurs collègues sont mis à l’honneur sur le site de l’INSB
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  • Les travaux de Adeline Goulet, Christian Cambillau et leurs collègues sont également mis à l’honneur en ce mois d’août dans la rubrique "En direct des labos" sur le site de l’INSB
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Évènements
  • Nuit Européenne des Chercheur.e.s 2018, 28 septembre : à Marseille au Dock des Suds, l’AFMB sera présent sur le parcours découverte !
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