Les équipes du laboratoire AFMB accueillent régulièrement des doctorants (3-4 ans) et étudiants en master-2 (6 mois) et master-1 (2 mois), issus principalement des quatre formations Biologie structurale, génomique (BSG), Pathologie humaine (PH), Microbiologie, biologie végétale et biotechnologies (MBVB) et Chimie organique, chimie verte, chimie du vivant (COCV2) ainsi que d’autres horizons (voir ci-dessous).
Elles accueillent également des stagiaires de licence (1-2 mois) et ingénieurs (2 mois) du cycle Génie biologique – biotechnologique de Polytech Marseille, ainsi que des visiteurs à plus court terme issus d’horizons divers (Marseille, France, ailleurs). Au niveau national, le laboratoire contribue aux formations en biologie structurale intégrative (ReNaFoBis).