CNRS - AIX MARSEILLE UNIV : UMR7257


Notre laboratoire


Le laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB), sous tutelle mixte du CNRS et de AMU, est un centre de biologie structurale localisé sur le campus de Luminy dans le Sud de Marseille, France, et en partenariat avec l’INRA sous la forme d’une unité sous contrat. L’objectif de nos recherches est de décrire à l’échelle moléculaire l’architecture des protéines ou des édifices macromoléculaires pour comprendre les mécanismes biologiques qui leur sont associés. La description des interactions entre macromolécules ou entre une macromolécule et son ligand fonctionnel est aussi nécessaire pour pouvoir agir sur ces systèmes complexes. Enfin, pour comprendre la diversité moléculaire structurale et fonctionnelle des membres de certaines familles de protéines, nous analysons les données de génomique massives issues de grands centres de séquençage


Séminaires
  • Lundi 14 janvier à 11h : Antonella Fioravanti, VIB-VUB Center for Structural Biology, Bruxelles, Belgique, "Characterisation and targeting of the Bacillus anthracis’ armor : the new way to fight Anthrax"

    Résumé (...)

    Résumé Anthrax is a highly resilient and deadly disease caused by the spore-forming bacterial pathogen Bacillus anthracis. Today, anthrax mostly affects wildlife and livestock, but remains a concern for human public health primarily in persons handling contaminated animal products and as a bioterror threat due to the high resilience of spores, the high case-fatality rate even with the aggressive use of antibiotics and the lack of a civilian vaccine program. As part of its immune evasion strategy, the bacterium presents a dynamic cellular surface with a complex composition. In its vegetative form, the cell surface of B. anthracis is covered by one of two protective protein arrays known as the Sap or EA1 S-layer (surface layer), present during exponential and stationary growth phase, respectively. The self-assembling characteristic of these S-layer proteins has thus far hampered their detailed structural and biophysical characterization. Successfully, I applied Nanobodies (Nbs) as a bio-tool to control Sap polymerization and to accomplish its crystallization and structure determination, unveiling a new class of S-layer proteins with a novel mechanism of assembly independent of calcium. Amongst the isolated Nbs I was also able to identify Sap inhibitory nanobodies that prevented Sap assembly and depolymerized existing Sap S-layers in vitro. When applied in vivo, nanobody-mediated effacement of the Sap S-layer resulted in severe morphological defects and proved bacteriostatic unlike the genetic knockout of sap. Encouraged by these findings, anti-Sap S-layer inhibitors are being developed as new promising tools to fight anthrax disease. To date, this novel anti S-layer Nanobody therapy resulted in clearance of ongoing B. anthracis infection in a mouse model curing them of lethal anthrax. These findings expose, for the first time ever, disruption of S-layer integrity as a mechanism with therapeutic potential in S-layer carrying pathogens.
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Actualités
  • Le labo AFMB et l’institut IMM mettent en place un nouveau module d’enseignement Master-2 de cryo microscopie électronique (CE2M)

  • Félicitations à Bernard Henrissat et Pedro Coutinho qui sont sur la liste Clarivate des chercheurs les plus cités au monde en 2018, pour la 5ème année consécutive !

Évènements
  • Le labo AFMB célèbre son 30e anniversaire et la database CAZy son 20e !
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