Responsable du groupe thématique « Stabilité des génomes viraux »

Financements : ERC Starting Grant: NidoRep – 101162788 (2025 – 2029)

Mes recherches sont axées sur le décryptage des différences de réplication et de transcription virales entre les virus à petit et à grand génome de l’ordre des Nidovirales. La plupart de ces virus ont été négligés, à l’exception de la famille des Coronaviridae (CoV) à grand génome (32 kb), qui comprend le célèbre pathogène humain SARS-CoV-2. À l’autre extrémité du spectre de taille, la famille des Arteriviridae (ArV) à petit génome (11 kb) contient plusieurs pathogènes répandus qui infectent les animaux. Je m’intéresse à la manière dont les enzymes virales clés, notamment la polymérase virale et son domaine unique N-terminal (le NiRAN), ont évolué pour réguler précisément la réplication virale au niveau structurel et fonctionnel. En particulier, mes recherches visent à déterminer comment ces enzymes ont été finement ajustées pour répondre aux exigences de réplication distinctes et conflictuelles de nidovirus aussi diversifiés.

octobre 2023 – présent : CNRS (CRCN)
avril 2018 – septembre 2023: Chercheuse postdoctorale AFMB/UMR7257, Réplication virale, structure, mécanismes & Drug-design, Dr. B. Canard (Marseille, France)
Dec 2016 – Mars 2018: VAXXAS Chercheuse dans l’industrie, Translational Research Institute (TRI), Brisbane, Queensland, Australia
Mars 2013 – Juin 2017: Doctorat en virologie et biologie moléculaire, School of Chemistry and Molecular Biosciences, University of Queensland, Australia. Directeurs: Professor Paul Young and Dr Keith Chappell. Intitulé: La protéase NS2B-NS3 du virus de la dengue, une cible pour les médicaments inhibiteurs

Publications

2025

2025
Nucleotide analogues and mpox: Repurposing the repurposable

Ashleigh Shannon, Bruno Canard

Antiviral Research 234:106057 (2025)10.1016/j.antiviral.2024.106057

2024

2024
The effects of Remdesivir's functional groups on its antiviral potency and resistance against the SARS-CoV-2 polymerase

Bhawna Sama, Barbara Selisko, Camille Falcou, Véronique Fattorini, Géraldine Piorkowski, Franck Touret, Kim Donckers, Johan Neyts, Dirk Jochmans, Ashleigh Shannon, Bruno Coutard, Bruno Canard

Antiviral Research 232 (2024)10.1016/j.antiviral.2024.106034

2023

2023
AT-752 targets multiple sites and activities on the Dengue virus replication enzyme NS5

Mikael Feracci, Cécilia Eydoux, Véronique Fattorini, Lea Lo Bello, Pierre Gauffre, Barbara Selisko, Priscila Sutto-Ortiz, Ashleigh Shannon, Hongjie Xia, Pei-Yong Shi, Mathieu Noel, Françoise Debart, Jean-Jacques Vasseur, Steve Good, Kai Lin, Adel Moussa, Jean-Pierre Sommadossi, Aurélie Chazot, Karine Alvarez, Jean-Claude Guillemot, Etienne Decroly, François Ferron, Bruno Canard

Antiviral Research 212:105574 (2023)10.1016/j.antiviral.2023.105574

2022

2022
A second type of N7-guanine RNA cap methyltransferase in an unusual locus of a large RNA virus genome

Ashleigh Shannon, Bhawna Sama, Pierre Gauffre, Théo Guez, Françoise Debart, Jean-Jacques Vasseur, Etienne Decroly, Bruno Canard, François Ferron

Nucleic Acids Research 50:11186-11198 (2022)10.1093/nar/gkac876

2022
A dual mechanism of action of AT-527 against SARS-CoV-2 polymerase

Ashleigh Shannon, Véronique Fattorini, Bhawna Sama, Barbara Selisko, Mikael Feracci, Camille Falcou, Pierre Gauffre, Priscila El Kazzi, Adrien Delpal, Etienne Decroly, Karine Alvarez, Cécilia Eydoux, Jean-Claude Guillemot, Adel Moussa, Steven S Good, Paolo La Colla, Kai Lin, Jean-Pierre Sommadossi, Yingxiao Zhu, Xiaodong Yan, Hui Shi, Francois Ferron, Bruno Canard

Nature Communications 13 (2022)10.1038/s41467-022-28113-1

2021

2021
Structure and Sequence Requirements for RNA Capping at the Venezuelan Equine Encephalitis Virus RNA 5′ End

Oney Ortega Granda, Coralie Valle, Ashleigh Shannon, Etienne Decroly, Bruno Canard, Bruno Coutard, Nadia Rabah

Journal of Virology 95 (2021)10.1128/JVI.00777-21

2021
A fluorescence-based high throughput-screening assay for the SARS-CoV RNA synthesis complex

Cecilia Eydoux, Veronique Fattorini, Ashleigh Shannon, Thi-Tuyet-Nhung Le, Bruno Didier, Bruno Canard, Jean-Claude Guillemot

Journal of Virological Methods 288:114013 (2021)10.1016/j.jviromet.2020.114013

2020

2020
Drugs against SARS‐CoV ‐2: What do we know about their mode of action?

Coralie Valle, Baptiste Martin, Franck Touret, Ashleigh Shannon, Bruno Canard, Jean‐claude Guillemot, Bruno Coutard, Etienne Decroly

Reviews in Medical Virology 30:1-10 (2020)10.1002/rmv.2143

2020
Rapid incorporation of Favipiravir by the fast and permissive viral RNA polymerase complex results in SARS-CoV-2 lethal mutagenesis

Ashleigh Shannon, Barbara Selisko, Nhung-Thi-Tuyet Le, Johanna Huchting, Franck Touret, Géraldine Piorkowski, Véronique Fattorini, Francois Ferron, Etienne Decroly, Chris Meier, Bruno Coutard, Olve Peersen, Bruno Canard

Nature Communications 11:4682 (2020)10.1038/s41467-020-18463-z

2020
Remdesivir and SARS-CoV-2: Structural requirements at both nsp12 RdRp and nsp14 Exonuclease active-sites

Ashleigh Shannon, Nhung Thi-Tuyet Le, Barbara Selisko, Cecilia Eydoux, Karine Alvarez, Jean-Claude Guillemot, Etienne Decroly, Olve Peersen, Francois Ferron, Bruno Canard

Antiviral Research 178:104793 (2020)10.1016/j.antiviral.2020.104793

2020
A N7-guanine RNA cap methyltransferase signature-sequence as a genetic marker of large genome, non-mammalian Tobaniviridae

Francois Ferron, Humberto Julio Debat, Ashleigh Shannon, Etienne Decroly, Bruno Canard

NAR Genomics and Bioinformatics 2 (2020)10.1093/nargab/lqz022