Ingénierie des Protéines pour les Biothérapies

Projets

Développement de trimères pour la vaccination VIH utilisant l’intelligence artificielle

L’un des principaux objectifs de notre groupe est de développer de nouvelles approches vaccinales contre le VIH. Grâce à l’intelligence artificielle, nous pouvons aujourd’hui concevoir des molécules aux propriétés inédites, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives pour la recherche vaccinale.

Nous développons notamment des trimères de l’enveloppe du VIH-1 (Env) constitués des sous-unités gp120, sans les sous-unités gp41. Ces nouvelles structures sont conçues pour limiter l’exposition de certaines régions du virus qui déclenchent habituellement des réponses immunitaires inefficaces contre l’infection. Grâce à cette plateforme innovante, nous cherchons à ouvrir de nouvelles voies pour le développement de vaccins capables d’induire des anticorps neutralisants à large spectre contre le VIH-1.

Monomères de gp120 pour la vaccination contre le VIH-1

Ce projet repose sur le développement d’immunogènes innovants dérivés de monomères de l’enveloppe du VIH-1. Ces nouveaux monomères sont conçus pour adopter une structure moléculaire proche de celle des trimères en conformation de pré-fusion. Ils visent à stimuler spécifiquement les cellules B capables de produire des anticorps neutralisants à large spectre. Ces molécules sont conçues pour préserver la structure naturelle de la sous-unité gp120 avant son interaction avec le CD4, tout en masquant certaines régions susceptibles de détourner la réponse immunitaire.

La capacité de ces nouvelles molécules à activer les cellules B spécifiques et à orienter leur maturation est évaluée en collaboration avec les équipes des Drs Pancera et Stamatatos (Fred Hutch Cancer Center, Seattle, États-Unis). Nous cherchons ainsi à développer de nouvelles stratégies pour la mise au point d’un vaccin efficace contre le VIH.

L’intelligence artificielle pour le développement de binders et d’immunogènes

Au-delà du VIH, notre groupe étend ses recherches à d’autres agents pathogènes pour lesquels il n’existe pas encore de vaccins efficaces. Nous nous intéressons particulièrement aux glycoprotéines virales et utilisons l’intelligence artificielle pour concevoir de nouveaux immunogènes capables de stimuler des réponses immunitaires ciblées.

En parallèle, nous collaborons avec d’autres équipes de recherche pour développer des binders, des protéines conçues pour reconnaître et se lier spécifiquement à une cible moléculaire. Grâce aux nouvelles approches de conception de protéines assistées par intelligence artificielle, nous cherchons à répondre à des besoins variés, tant pour la recherche fondamentale que pour le développement de nouvelles applications biomédicales.